Chaque année, en mai ou en juin, les délégués des différentes sections se réunissent à l'occasion de l'assemblée des délégués. Celle-ci définit les orientations stratégiques, qui découlent des propositions formulées par les sections et le comité central.

Il s'agit notamment de revendications adressées à l'employeur, mais aussi d'actions, de résolutions et d'autres initiatives politiques.

Par ailleurs, l’assemblée des délégués arrête notamment les règlements, les modifications des statuts et les partenariats de coopération avec d’autres organisations.

Le congrès ordinaire de Garanto a lieu tous les quatre ans ; le prochain se tiendra en 2028. Un congrès extraordinaire peut être convoqué à la demande du comité central.

Le congrès élit en premier lieu le président central et les membres du comité central. Il statue également sur les accords de coopération importants avec des organisations partenaires, tels que l’adhésion à des organisations faîtières, les accords avec des organisations partenaires ou les contrats de prestation de services avec des prestataires externes. En outre, le congrès peut décider d’une modification du montant des cotisations des membres.