Jedes Jahr im Mai oder Juni treffen sich die Delegierten der verschiedenen Sektionen zur Delegiertenversammlung. Diese beschliesst die strategischen Stossrichtungen. Diese kommen aus den Anträgen der Sektionen und des Zentralvorstands zusammen.

Dazu gehören Forderungen an den arbeitgeber, Aber auch Aktionen, Resolutionen und sonstige politische Initiativen.

Zudem legt die Delegiertenversammlung unter anderem Reglemente, Statutenänderungen und Partnerschaften der Zusammenarbeit mit anderen Organisationen fest.

Der ordentliche Kongress von Garanto findet alle vier Jahre statt, das nächste Mal im Jahr 2028. Auf Antrag des Zentralvorstands kann ein ausserordentlicher Kongress einberufen werden.

In erster Linie wählt der Kongress den Zentralpräsidenten und die Mitglieder des Zentralvorstands. Daneben beschliesst der Kongress wichtige Zusammenarbeitsverträge mit Partnerorganisationen, wie z.B. Mitgliedschaften bei Dachorganisationen, Verträge mit Partnerorganisationen oder Dienstleistungsverträge mit externen Anbietern. Daneben kann der Kongress eine Änderung der Mitgliederbeiträge beschliessen.